Anjali Jay

Mulder e Scully scoprono di non essere i soli a cercare disperatamente il loro figlio scomparso, William. Il destino stesso del mondo potrebbe dipendere da questo.

Kellog colpisce Alec al cuore con il rapimento di Emily. Kiera prova a negoziare il suo rilascio.

John Doe si è rivelato essere dell'anno 2039 e si chiama Brad Tonkin. Mentre Brad scompare, Kiera e Carlos scoprono che Dillon sta coprendo una serie di violenti attacchi da parte dei tester del dispositivo Halo di Alec. Mentre Carlos chiede aiuto a Julian, Kiera riesce a rintracciare Brad nella sua casa d'infanzia, ma vengono liberati da Liber8.

Kiera indaga su un amnesico John Doe quando si risveglia dopo 2 mesi senza sapere altro che il suo nome. Nel frattempo, Kiera e Carlos indagano su una serie di furti tecnologici di alto profilo alla Piron Corp. Kiera in seguito si avvicina a John Doe e gli racconta della sua vita quando scopre che potrebbe essere dal futuro.

Mesi dopo, Alec ed Emily sopravvivono per un tentativo di omicidio. Ritornano a unire le forze con Kiera e Brad per fermare i piani di Alec di accelerare l'ascesa di Piron e il lancio di Halo.