Joshua Leonard

In Syracuse wird die 25-jährige Molly Grandin vermisst. Ihr Wagen steht dort, wo auch Monate zuvor das Auto einer anderen vermissten Frau, Gail, entdeckt wurde. Gail lag wenig später tot im Onondaga-See. Die Profiler suchen nach Gemeinsamkeiten und entdecken, dass beide Frauen im selben Krankenhaus in psychologischer Behandlung waren, wenn auch in unterschiedlichen Programmen. Garcia macht sich auf Spurensuche und findet schließlich den entscheidenden Hinweis ...

Ein veralteter Atomreaktor droht zu überhitzen und in die Luft zu fliegen. Der einzige, der Team Scorpion bei diesem Problem helfen kann, ist das ehemalige Mitglied Mark Collins. Der psychisch labile Mann hat über Jahre hinweg die Kommunikation rund um den Reaktor angezapft und kennt alle Details des Meilers. In einer waghalsigen Aktion versuchen die Genies, den GAU abzuwenden. Doch ausgerechnet Collins ist nicht ganz unschuldig an der drohenden Katastrophe.

Als im Wald eine kopflose Leiche gefunden wird, hören Brennan und ihr Team auch von der Legende einer kopflosen Hexe, die in jenem Wald ihr Unwesen treiben soll. Tatsächlich führen die Schauergeschichten sie auf die Spur der Mörder.

Während eines Schulausflugs im Museum ist Ralphs Freund Daniel plötzlich wie vom Erdboden verschluckt. Daniel hat nonverbalen Autismus und kann sich nur über ein Tablet verständigen. Der Söldnerring „S6“ benutzt in ebendiesem Museum einen Mülleimer als Übergabeort eines – identisch aussehenden – Tablets zur Steuerung intelligenter Munition; durch eine Verspätung bei der Übergabe kommt es zur Verwechslung zwischen Daniels Tablet und dem des S6 …

Im Finale der zweiten Staffel muss Team Scorpion ihren unberechenbaren Ex-Kollegen Mark Collins (Gaststar Joshua Leonard) überlisten, nachdem er Toby entführt hat und droht, ihn umzubringen, wenn seine listigen Forderungen nicht erfüllt werden.

Team Scorpion reist nach Tschernobyl, um den maroden Kernreaktor vor einer katastrophalen Kernschmelze zu reparieren. Dabei müssen sie Sylvester und Paige retten, die im Reaktor festsitzen.