Drei jüdische Gemeindevorsteher werden getötet. Weil alles auf Hass als Motiv hinweist, ermittelt Danny in antisemitischen Kreisen. Linda wird ausgeraubt und traut sich nicht mehr ohne eine Waffe aus dem Haus.
Das Serienfinale zeigt Gotham in der Vorausblende ein Jahrzehnt in der Zukunft, als Bruce Wayne zurückkehrt. Der Penguin und Riddler treiben weiterhin ihr Unwesen, als der Dark Knight auftaucht.
Während Bane seinen Plan, Gotham zu zerstören, umsetzt, trommelt Gordon seine ehemaligen Feinde zusammen, um die Stadt zu retten. Bruces Entscheidung Gotham zu verlassen, erschüttert Selina.
Gordon und der Pinguin müssen zusammen arbeiten, als Haven angegriffen wird. Währenddessen führt Selina ihren Rachefeldzug gegen Jeremiah (CAMERON MONAGHAN) fort.
Nachdem Gordon angeschossen wurde, halluziniert er über einen Prozess, in dem es um sein Leben geht - und reale tödliche Konsequenzen haben kann. Ivy kehrt zurück und bezirzt Bruce.