Marshall Allman

Meredith und Derek bekommen eine letzte Chance auf Erfolg in ihrer klinischen Studie; die Chirurgen arbeiten zusammen, um einen Jungen aus einem Zementblock zu befreien; Lexie entdeckt Informationen über Georges Status als Praktikant.

Michael Scofield steht in Panama unter Mordverdacht. Ihm blüht ein unerfreulicher Aufenthalt hinter Gittern - und zwar in einem ganz besonderen Gefängnis: Sona. Dies ist ein Gebäudekomplex mit Hof, mit scharf bewachten Mauern, innerhalb derer die Häftlinge sich selbst überlassen sind. Das Treiben ohne Gittertüren und patrouillierende Wärter ist nur auf den ersten Blick anarchisch, hat sich doch nach dem Gesetz des Stärkeren durchaus eine Ordnung etabliert, an deren Spitze ein despotischer Gefangener steht: Lechero. Dieser sieht seine Vorherrschaft durch den Neuankömmling Scofield gefährdet, sodass ihm gerade recht kommt, dass ein Mithäftling Michael des Diebstahls bezichtigt.

Nach seinem erfolgreichen Ausbruch aus Sona lebt Michael nur noch dafür, Saras Tod zu rächen. Deshalb verfolgt er Whistler bis nach Los Angeles, der dort gemeinsam mit Saras Mörderin Gretchen und Mahone versucht, in den Besitz einer Speicherkarte zu gelangen, auf der sich eine Datei namens 'Scylla' befindet. Diese 'Scylla' enthält hochbrisante Informationen, mit denen man die Company zur Strecke bringen könnte. Während der Suche nach der Karte versichert Gretchen Michael glaubhaft, dass Sara noch immer lebt. Und während Michael daraufhin alles versucht, um Sara wiederzufinden, übergibt Gretchen die erbeutete Speicherkarte ihrem Boss, der aber schnell herausfindet, dass sich darauf nur eine Kopie der 'Scylla'-Daten befindet, die von Whistler heimlich angefertigt wurde. Und so gerät Gretchen an diesem Tag ein zweites Mal in große Lebensgefahr ... Unterdessen überzeugt Mahone Michael davon, sich mit Whistler zu treffen. Bei diesem Treffen schafft es Whistler gerade noch, Michael zu bestätigen, dass Sara noch lebt und ihn in Details über 'Scylla' einzuweihen, bevor der Company-Agent Wyatt auftaucht und Whistler erschießt. Leider erhält Wyatt auch den Auftrag, jeden aufzuspüren und aus dem Weg zu räumen, der mit Whistler irgendwie in Verbindung gestanden hat.

Michael versucht, seinen Fluchtplan den aktuellen Gegebenheiten anzupassen und erfährt von Tyge mehr über Whistlers Vergangenheit. Schade nur, dass Tyge kurz darauf ermordet wird und ausgerechnet Whistler bei Lechero unter Mordverdacht gerät, der solche Vergehen in Sona mit der Todesstrafe ahndet. Michael muss also alles versuchen, um Whistlers Unschuld zu beweisen und ist dafür sogar bereit, Mahone als Tyges Mörder an Lechero auszuliefern. Unterdessen entbrennt ein gnadenloser Machtkampf zwischen Sammy, T-Bag und Cheo, bei dem höchstwahrscheinlich erst einmal Cheo auf der Strecke bleiben wird. Und obwohl Lincoln alles tut, um seinem Sohn L.J. das Leben zu retten, indem er gemeinsam mit Sofia außerhalb des Gefängnisses ganz entscheidende Fluchtvorbereitungen trifft, bringt er das Leben seines Sohnes in höchste Gefahr, weil er Susan B. gegenüber verheimlicht, wann genau der Ausbruch stattfinden soll ... Aber Lincoln hat noch ein weiteres Problem: Michael ist nur bereit, Whistler aus dem Gefängnis herauszuholen, wenn er ein aktuelles Foto von Sara erhält, das beweist, dass sie noch lebt ...

Nach dem gescheiterten Fluchtversuch steckt Michael in der Klemme. Der neue Gefängnisdirektor verdonnert ihn zur Haft in einem Käfig in der brütenden Hitze, um an Informationen über seine Helfer zu kommen. Am Ende seiner Kräfte angekommen packt Michael aus und belastet Whistler, der wiederum Susan denunziert. Sofia, Lincoln und Sucre sind nach wie vor bemüht, aus all den widersprüchlichen Informationen etwas Brauchbares herauszufiltern. Vor allem Sofia hadert mit der Situation, sieht sie ihr Misstrauen gegen Whistler doch bestätigt, nachdem sie seine geheime zweite Wohnung und den Reisepass entdeckt hat. Nach einer lautstarken Auseinandersetzung mit Lincoln wird Sucre von Susan angegangen, um ihn als Informant anzuwerben.