Peter Outerbridge

Un avion est retrouvé dans l'aéroport international Logan de Boston (Boston's Logan Airport). Tous les passagers et l’équipage sont morts d’une façon effroyable, l’agent spécial du FBI Olivia Dunham est alors appelée pour mener l’enquête. Celle-ci prend une tournure des plus dangereuses lorsque son partenaire, l’agent spécial Agent John Scott, échappe de peu à la mort. Olivia Dunham trouve de l'aide auprès du Dr. Walter Bishop, qui accepte à une seule condition : il veut revoir son fils dont il a été séparé par le gouvernement. Avec l’aide de l’agent Phillip Broyles, ils vont découvrir que le crash fatal n’est qu’une petite pièce d’une grande et terrible vérité.

2015 : Cole oblige Aaron à lui dire qui sont les personnes qui ont envoyé le « grand homme livide » les tuer. Aaron parle d'un groupe d'investissement qui finance Markridge. Jennifer vient de prendre le contrôle de la société de son père.

En 2016, Jennifer Gones décide de reprendre le contrôle de sa vie. Elle crée le groupe des Hyènes avec d'autres femmes psychologiquement instables pour lancer une offensive contre l'Armée de 12 Singes.

Un androïde rebelle faisant partie de l'équipage de Ganymède menace de détruire la dernière chance de survie de la Terre, disant que les humains sont une infestation dans l'univers et ne méritent pas de vivre. Et il a peut-être raison.

L'équipe se rend au Canada suivant les rapports d'un poltergeist meurtrier. Ils rencontrent d'autres experts du paranormal dont l'un d'eux, Thomas Edison, leur montre son Nécrophone, appareil servant selon lui à communiquer avec les morts.

Le FBI est contraint de faire appel à Beaumont et ses équipiers pour faire face à un dangereux sociopathe qui cible les diabétiques avec de l'insuline contaminée. Plusieurs vies sont en jeu et les négociations s'annoncent tendues.