Dans l'enceinte du Vatican, se trouvent les musées les plus extraordinaires au monde recelant de trésors de Raphaël, d'une chapelle Sixtine jamais inégalée et de dizaines de milliers d'oeuvres et documents historiques... Chaque année, plus de 4 millions de visiteurs viennent en percer les mystères.

Cet épisode raconte l'histoire de certaines oeuvres exposées au musée du Louvre à Paris que le visiteur ne connaît pas toujours. Parmi tous les trésors que ce fabuleux musée recèle, des oeuvres au caractère singulier et inattendu. Au-delà des espaces ouverts au public, en coulisses, derrière ses portes blindées, le Louvre vibre d'une vie aussi agitée que secrète, même la nuit.

Au sein du musée égyptien du Caire, c'est une véritable chasse aux trésors qui s'engage ! Notamment à la recherche du tombeau perdu de Ramsès le Grand : était-il un souverain brave ou un roi lâche ? Par ailleurs, pourquoi les Égyptiens anciens ont momifié des chats, des babouins et des faucons par millions ? Que nous apprennent les inscriptions secrètes sur les pyramides ?

L'examen d'un crâne nous permet de nous interroger : les hommes préhistoriques de Grande-Bretagne étaient-ils des cannibales ? Puis, nous découvrons une gemme réputée qui tue tous ceux qui la touchent, nous pénétrons une pièce secrète, et tentons de comprendre l'extinction de l'oiseau dodo...

A la vue de l'armure de Henry VIII, nous tentons de découvrir comment il est devenu si gros et... si fou ! Le Metropolitan Museum de New York, autrement appelé MET, abrite aussi le Saint Graal, ce qui nous donne l'occasion de comprendre le pouvoir de certaines reliques religieuses. Dans le laboratoire du musée doté de la dernière technologie de la NASA, les scientifiques utilisent l'art pour résoudre des mystères, non seulement anciens mais parfois actuels.

Visité par plus de 4 millions de personnes chaque année, le Musée américain d'histoire naturelle dispose de pas moins de 32 millions d'objets et emploie une équipe de chercheurs active, à la tête de plus de 100 expéditions par an. Ainsi, dans cet épisode, nous voyons comment ils capturent certains animaux afin de leur extraire leur ADN, véritable témoin de la vie animale actuelle pour les générations à venir.