Tras recibir un aviso de un detective local, el equipo viaja a Kansas City para investigar un informe de personas sin hogar que desaparecen misteriosamente de las calles de la ciudad.
Fuerzas ocultas abducen a Scully, y Mulder inicia una búsqueda desesperada para encontrarla, pero se ve frustrada por una traición sorprendente.
Mientras Scully está comatosa batallando por su vida, Mulder descubre pistas de la abducción que lo llevan a enfrentar al Fumador.
Los agentes descubren lo que parece ser prueba tangible del contacto del gobierno con los extraterrestres mientras investigan el video de una supuesta autopsia de un alienígena.
Mulder y su nuevo compañero, Alex Krycek, se enfrentan a un infante de marina desvelado, quien tendría la capacidad de matar con sus sueños.
