MacGyver se entera de que el hijo de Pete Thornton, Michael, está involucrado en una red de espionaje internacional que roba secretos de la Fundación Phoenix.
Lilly y el equipo reabren el caso de 1973 sobre el asesinato de un jugador de fútbol americano tras encontrarse nuevas pruebas.
El Sr. Zelinka se ve obligado a jubilarse.