El Dr. Hell ha vuelto con fuerza, y el Equipo Mazinger sufre una derrota aplastante. El Mazinger Z es robado y Kouji Kabuto desaparece. Cuando el enemigo ataca con el robot robado, Kouji reaparece pilotando al poderoso Mazinkaiser. Pero su poder es tan descomunal que despierta dudas: ¿es esta nueva arma un salvador o una amenaza aún mayor? La batalla definitiva está por comenzar.