Todo Japón lucha desesperadamente contra unos seres extraterrestres que están aniquilando poco a poco a su población.

Años después de la invasión de los BETA, aparece Takeru, un joven que dice haber regresado al pasado con el conocimiento de la Alternativa V.

Pese a todo lo ocurrido, nuestro protagonista sabe bien qué quiere proteger en este mundo que no es el suyo original.

Gracias al conocimiento de Takeru y sus maniobras en combate, la doctora finalmente consigue implementar un nuevo SO para las máquinas que mejorará su capacidad de combate.