Una serie de apagones en la ciudad de Los Ángeles hace que un asesino en serie salga de su escondite, dándole nuevas oportunidades para continuar con su matanza.
El equipo de la UAC se acerca al asesino en serie mientras continúa con su serie de asesinatos por todo Los Ángeles con la hija del detective Spicer secuestrada como su rehén.
En una misión, el equipo es emboscado por Kolya, quien ahora ha creado su propia facción de Genii tras ser expulsado del círculo íntimo. Mientras el resto del equipo logra escapar, Sheppard es tomado prisionero.
Sheppard (Joe Flanigan) juega al gato y al ratón mientras intenta recuperar el control de Atlantis, ya que los Genii han tomado como rehén a la ciudad, a Weir (Torri Higginson) y a McKay (David Hewlett).
Sheppard y Teyla descubren que una gran tormenta se aproxima. El equipo debe evacuar la ciudad, y los manarianos se ofrecen a darles refugio. Mientras buscan una forma de activar el escudo, la ciudad es invadida por los Genii.
