S2, F5: In der Gegenwart befinden sich Cassie (Amanda Schull) und Jennifer Goines (Emily Hampshire) auf der Flucht vor den letzten 12 Monkeys. Dies ist ein verzweifelter Versuch, den nächsten Teil der Verschwörung zu entwirren. Währenddessen spitzt sich in 2044 der Konflikt zwischen Cole (Aaron Stanford) und Ramse (Kirk Acevedo) mit Deacon (Todd Stashwick) zu.