Der letzte Teil der Anime-Trilogie: Der grausame Godzilla herrscht weiterhin über die Erde, denn bisher konnte nichts das Ungetüm beseitigen. Seine letzte Chance sieht Haruo Sakaki in einem Bündnis mit den Exif. Durch die Fähigkeiten dieses Volkes soll ein mächtiger Drache namens Ghidorah heraufbeschwört werden. Ein brutaler Kampf zwischen zwei Bestien beginnt ...