Nach einem Defekt in einer Achterbahn bangen die Fahrgäste um ihr Leben. Athena und Hen untersuchen einen ungewöhnlichen Einbruch.
Sam, Callen und Roundtree reisen nach Afghanistan. Dort führen sie die Ermittlungen in einem besonders sensiblen Fall. Zwei Navy SEALs haben ausgesagt, dass ihr Vorgesetzter einen unbewaffneten Gefangenen ermordet habe.
Das NCIS-Team unterstützt das Justizministerium bei der Untersuchung einer Reihe von Brandanschlägen. Zuletzt geriet das Haus eines FBI-Agenten in dessen Visier. Der beschützt einen politischen Aktivisten, der in den USA einen Asylantrag gestellt hat. Eric versucht noch immer mit Nells Abschied zurecht zu kommen.
Sam untersucht den Mord eines iranischen Exilanten, der in den USA am Umsturz des jetzigen Regimes arbeitete. Zeitgleich entwickelt sich der erste Tag des neuen Agenten Devin Roundtree zum reinsten Abenteuer. Aus Versehen löst der nämlich die Detonation einer Bombe aus. Währenddessen trifft Nell eine schwerwiegende Entscheidung.
Ein FBI-Agent wird getötet und die Agenten stellen fest, dass er versucht hatte, den Aufenthaltsort eines Undercover-Agenten zu ermitteln. Nun liegt es an dem NCIS-Team diesen Mann zu finden, bevor es die Kriminellen tun.