Booth hat die Verlobung mit Brennan wieder aufgelöst, was zu einer eisigen Stimmung zwischen den beiden geführt hat. Eine Leiche in einer Hotelbelüftung sorgt unterdessen für Gänsehaut bei den Gästen.
Das Team untersucht den Mord an einer Afghanin, welche die CIA bei Bekämpfung der Taliban unterstützt hat. Alle Spuren führen Brennan und Booth zu einem Terroristen, der eigentlich als tot gilt.
Die Kanzlei vertritt einen Klienten, der ein Einkaufszentrum in einer Gegend bauen will, in der Wildlachse laichen. Die Gegenseite ist eine Umweltschutzorganisation, die von Denny Cranes Sohn unterstützt wird.
Shirley Schmidt zwingt Alan Shore dazu, ihr bei einem Fall zu helfen: Ein Polizist hat dem Bruder eines Kidnappers den Arm gebrochen, um herauszufinden, wo sich der Verdächtige mit dem entführten Kind aufhält.
Während ihre männlichen Kollegen mehr als begeistert über die attraktive neue Kollegin Marlene Stanger sind, hat Denise massive Schwierigkeiten mit der kämpferischen jungen Frau, die ihren Spitznamen "Tintenfisch" offensichtlich verdient.