Ein Ex-FBI-Agent, der im Ruhenstand alte Fälle bearbeitete, wird ermordet. Holmes und Watson (Jonny Lee Miller, Lucy Liu) verfolgen die Spur bis zum Fall von Mina Davenport, die nach einer zehn Jahre dauernden Entführung wieder auftauchte. Doch die junge Frau, kann unmöglich die entführte Mina sein.
Danny hatte einst vergeblich versucht, den Serienmörder Thomas Wilder hinter Schloss und Riegel zu bringen. Jetzt ist Wilder zurück und sinnt auf Rache.
Die Sondereinheit für Sexualdelikte will einen Mädchenhändler-Ring hochgehen lassen und steckt plötzlich mitten in einer Ermittlung gegen Terroristen.
Nachdem ein Sniper zweimal auf die New Yorker Polizei gezielt hat, ist die Sondereinheit in Aufruhr. Offenbar hat der Täter noch eine Rechnung mit Detective Tutuola (Ice-T) offen. Während der seine alten Fälle aus dem Drogendezernat unter die Lupe nimmt, geht die Serie der Gewalt weiter. Gemeinsam mit FBI-Lieutenant Alexandra Eames (Gast: Kathryn Erbe) startet die Sondereinheit ein Wettrennen gegen die Zeit - und die Jagd nach einem Täter, mit dem niemand gerechnet hat.
Die Rehabilitationsstation Emerald City bekommt einen neuen Bereichsleiter. Martin Querns (Reg E. Cathey) Methoden, um auf dem Flur für Recht und Ordnung zu sorgen, sind nicht gerade streng. Der gefeuerte Ex-Wärter-Chef Tim McManus (Terry Kinney) kehrt unterdessen ins Hochsicherheitsgefängnis Oz zurück. Doch mit welcher Funktion? - Nichts für zarte Gemüter: Knallharte Knastserie aus dem Hause HBO von Emmy-Preisträger Tom Fontana.