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Nachdem sie das erste Oberstufenjahr in Ruhe und Frieden verbracht hatten, trafen Haruka und Makoto Nagisa, einen neuen Studenten, der ein Mitglied eines Schwimmclubs war, als sie Kinder waren. Der Schwimmclub wird abgerissen, also schleißen die drei sich dorthin, um eine Zeitkapsel auszugraben, als sie sich plötzlich mit dem vierten Mitglied der Gruppe, Rin, vereinigt finden, der damals gega...

Makoto und Nagisa beobachten gespannt das Wettschwimmen zwischen Haruka und Rin. Dabei bemerken sie, dass sich Rin verändert hat. Zugleich beginnt Nagisa, mit Hilfe von Rin's Schwester Gou, einen neuen Schwimmclub zu eröffnen.

Um an Staffelwettkämpfen teilnehmen zu können, benötigt der Iwatobi-Schwimmclub mehr Mitglieder. Nagisa setzt seine Hoffnungen auf seinen Mitschüler Rei, der eigentlich Mitglied im Leichtathletikclub ist. Rei ist davon aber nicht begeistert.

Der Iwatobi-Schwimmclub ist jetzt vollbesetzt!Schon zu Beginn der Übungen gibt es allerdings Ärger.Nachdem ein gewisses Mitglied meint, die Schwimmkleidung sei schuld, unternimmt der Club einen Ausflug, um sich neue Ausrüstung zu besorgen.

Haruka und sein Team veranstalten ein Trainingscamp, um sich für die Präfektur-Wettkämpfe vorzubereiten. Im Training fällt auf, dass noch nicht alle Mitglieder ihr Niveau erreicht haben.

Die vier Mitglieder werden dazu gezwungen, deren Motivation zum Schwimmen zu überdenken. Als Rei Makoto auf sein seltsames Verhalten anspricht, erzählt Makoto ihm von seiner Vergangenheit.