Francis ist nach wie vor nicht zu Bewusstsein gekommen und alle machen sich Sorgen, dass er sterben könnte. Als Mary erfährt, dass die Bürger Schottlands von Protestanten angegriffen werden, versucht sie, französische Soldaten zu entsenden, wird jedoch von Catherine aufgehalten. Bash fürchtet, dass er für Francis’ schlechten Zustand verantwortlich sein könnte und ergreift drastische Mittel.

Mary hat sich für den erkrankten Francis entschieden, und somit auch für Frankreich. Als Louis sie bittet, gemeinsam mit ihm das Land zu verlassen, lehnt sie das Angebot ab. Louis, der sich nicht mehr sicher fühlt, entscheidet sich unter diesen Umständen zu einem weitreichenden Schritt. Lola und Kenna statten Greers Bordell einen Besuch ab und sind erstaunt, wie erfolgreich es bereits läuft.

Mary setzt alle Hebel in Bewegung, um Francis davon abzuhalten, den flüchtigen Louis zu fassen. Catherine, die wegen Narcisses Beziehung mit Lola sehr eifersüchtig ist, bittet ihn, etwas Unverzeihliches zu tun, um seine Loyalität unter Beweis zu stellen. Kenna überschreitet mit General Renaude eine Grenze und Greer trifft eine Entscheidung, die das Ende ihrer Beziehung mit Leith bedeuten könnte.

Mary und Francis müssen ihre privaten Schwierigkeiten beiseite schieben, als die feindlichen Truppen das Schloss einnehmen wollen. Louis ist es mit einer Erpressung gelungen, auch Renaude auf seine Seite zu ziehen. Bei dem Angriff auf das Schloss gerät Renaude aber in Gefangenschaft und wird eingesperrt. Mary erfährt, dass sie schwanger ist, und will heimlich zu Louis, um ihn um Schutz zu bitten.

Mary setzt alles auf eine Karte, um Condé das Handwerk zu legen, selbst als Francis zu Bedenken gibt, dass sie sich mit ihrem Vorhaben gegen Frankreich wendet. Catherine unternimmt ebenfalls einen wagemutigen Schritt und trifft sich mit Queen Elizabeth, um mit ihr gemeinsam Rache an Mary zu nehmen. Kenna hat indes ein Geheimnis, das das Schicksal ihrer Beziehung mit Bash besiegelt.

In England schmieden Catherine de Medici und Elizabeth I. ein Komplott gegen Mary: sie schicken Boten zum Vatikan um Marys Affäre mit Louis Condé zu enthüllen. Die Boten erreichen ihre Ziel niemals, doch Catherine hat schon wieder einen neuen Plan ausgeheckt. Auf ihr Geheiß hin sendet Elizabeth ein Heiratsgesuch für Francis jüngeren Bruder Charles nach Frankreich. Derweil werden in Frankreich die Vorräte knapp. Francis und Mary heuern einen Freibeuter namens Martin an, um für sie neue Ressourcen zu erschließen.

Mary und Francis erzählen Claude, Charles und Bash von Francis baldigem Tod und bitten Charles Mary zu heiraten, um ihre Sicherheit am französischen Hof auch weiterhin zu gewährleisten. Charles lehnt zunächst entsetzt ab, ändert jedoch seine Meinung als Catherine ihn für ihre eigenen hinterhältigen Pläne zu benutzen versucht. Nach dem Verschwinden von Catherine de Medici kommt Elizabeth in Erklärungsnot.

Francis geht es immer schlechter und die Gerüchte über seinen Gesundheitszustand verbreiten sich schnell. Auch Antoine von Navarra und der englische Botschafter Nicholas hören davon. Antoine braucht Hilfe von Francis, die er auch bekommt als er seinen Anspruch auf den französischen Thron offiziell aufgibt. Als Charles mit einer Freundin Opium konsumiert bricht diese unter einer Überdosis zusammen. Nur durch Narcisses Eingreifen kann ihr Leben noch rechtzeitig gerettet werden.

Für Marie de Guise wird die Situation mit den Protestanten in Schottland langsam kritisch. Um ihr zu helfen, manipulieren Mary und Francis den englischen Botschafter Nicholas, der daraufhin falsche Informationen an Königin Elizabeth weitergibt. Dieser wird mittlerweile von Don Carlos der Hof gemacht, wird aber von ihr abgewiesen. Derweil verspricht Robert seiner Frau die Affäre mit der englischen Königin zu beenden. Bash hat endlich Delphine gefunden und kann sie befreien.

Francis hat sich sichtlich von seiner Krankheit erholt, dank Delphine. Mary stimmt einem Friedensangebot von Elizabeth zu und unterzeichnet das Dokument zum Verzicht all ihrer Ansprüche auf den englischen Thron. Doch die Gefahr ist noch nicht vorüber. Nostradamus kehrt an den französische Hof zurück um Catherine und Francis zu warnen. Er hat in seinen Visionen erneut Francis Tod gesehen. Unbeirrt dessen will Francis mit Mary nach Paris fahren. Auf dem Weg dorthin wird das junge Königspaar überfallen.

Drei Wochen sind seit dem Tod von Francis verstrichen, doch der Kampf um die Regentschaft hat gerade erst begonnen. Mary löst die schottisch-französische Allianz, will jedoch solange in Frankreich bleiben, bis sie eine neue gefunden hat. Zu diesem Zweck lässt sie nach Don Carlos schicken. Catherine verführt Narcisse, um seine Ehe mit Lola zu sabotieren und sich gleichzeitig seine Stimme für die Abstimmung über die Regentschaft zu sichern. Elizabeth ist von Nicholas enttäuscht.