Ex-Geheimagent Tom Keen macht sich daran, ein ruhiges Familienleben mit seiner Frau Liz zu führen, als ihn ein Anruf des Anwalts seines verstorbenen Vaters erreicht. Er soll nach New York zur Besprechung seines Testaments fliegen.
Der amerikanische Journalist Kevin Jensen wird in einem fiktiven Land namens Kyrkistan von den Behörden festgenommen und beschuldigt, verdeckt ermittelnder CIA-Agent zu sein.
Scottie erfährt, dass Howard ohne ihr Wissen eine Mission geplant hatte, bei dem Informationen über ein russisches Geheimprojekt gesammelt werden sollen. In dem russischen Projekt sollen Agenten ausgebildet werden, die als amerikanische Bürger getarnt, Anschläge verüben sollen. Nez und Tom können einen Anschlag dieser Art vereiteln. Howard ist unterdessen davon überzeugt, dass Scottie eine Doppelagentin aus dem Projekt der Russen ist.
Aus einem geheimen CIA-Gefängnis mitten in Manhattan fliehen fünf hochgefährliche Terroristen. Um nichts an die Öffentlichkeit dringen zu lassen, wird Halcyon damit beauftragt, die Verbrecher zu finden.
Nach einem Giftgasanschlag auf Flüchtlinge in Deutschland erhält Halcyon den Auftrag, nach den Leuten zu suchen, die das Gas beschafft haben.
Nachdem die wohlhabende Familie Lang von Diego Rocha entführt wird, erhält Scottie den Auftrag, die Familie zu befreien. Doch Rocha fordert im Austausch für die Familie die Freilassung seines ehemaligen Komplizen Carlos Cantara. Der hat längst die Seiten gewechselt und arbeitet als Informant für das FBI. Derweil findet Tom heraus, wo Howard versteckt wird, doch scheitert er bei dem Versuch ihn zu befreien.
Famke Janssen
Susan "Scottie" Hargrave
Ryan Eggold
Tom Keen
Edi Gathegi
Matias Solomon
Tawny Cypress
Nez Rowan
Adrian Martinez
Dumont