S1, E2: I Chain of Commands andet afsnit fortsætter krigen mod ekstremisme verden over. I Irak, efter den amerikansk-irakiske sammenslutning erobrer det østlige Mosul, fortsætter kampen i byens vestlige del. I mellemtiden forbereder en flådesergent sig på at blive sendt til Afghanistan, og på den caribiske ø Trinidad kæmper det muslimske samfund med, at deres unge forlader dem for at kæmpe for ISIS.