Jim Gleason

I anden sæsons første afsnit finder Jane og Lisbon ud af, at Red John-sagen er blevet overgivet til et nyt CBI-team, som ledes af den regelrette Sam Bosco (TERRY KINNEY).

Da en familie ankommer til Seattle Grace Hospital efter et alvorligt biluheld, erfarer Alex, at deres kvæstelser kun er begyndelsen på deres problemer.

Da en ung kvinde forsvinder fra et rigt kvarter i Sarasota, tror CA, at hun kan være blevet taget som gidsel af den ene part af et par seriemordere.

Castle og Beckett efterforsker dødsfaldet på et cykelbud ramt af en flugtbilist, brutalt myrdet for at forhindre ham i at aflevere en pakke, hvis indhold kunne befri en uskyldig mand fra fængsel. I en overraskende drejning forbindes dette tragiske dødsfald med en mordsag, som Kaptajn Montgomery efterforskede ti år tidligere. For at løse det nye mord, må Castle og Becket trække vod i fortiden og afdække en prominent New Yorker families hemmeligheder og skandaler.

Larry hyrer en privatdetektiv for at få blotlagt sandheden om en personlig hemmelighed, adopterer en "racistisk" hund og mister – midlertidigt – sin status som forkæmper for lesbiske kvinders rettigheder.

Menneskelige rester fundet på udgravningsstedet til en ny bygning fører Rush og Valens til at undersøge de uopklarede dødsfald af en mand og en kvinde i midten af 20'erne, der forsvandt i 1969.