Tom McElroy

Jose Vargas er tvunget til at gå på orlov efter at have pådraget sig en skade i en brand.

Tiden er ved at rinde ud, og Michael må bede sin cellekammerat, Sucre, om hjælp til at udføre sin detaljerede flugtplan. Men Sucre vil intet have med det at gøre og beder om at blive flyttet. Michaels nye cellekammerat, Haywire, er endnu værre, end han lyder. I mellemtiden møder Veronica en kvinde, som muligvis kan hjælpe med at få sat en stopper for Lincolns henrettelse.

Michaels flugtplan har vist sig at holde vand, men han må samle alt sit mod for at overkomme den sidste forhindrings højder. Datoen for flugten rykker nærmere, og gruppen forsøger at skille sig af med et medlem. Udenfor murene sniger LJ sig til sin mors begravelse og Veronica får et opkald fra uventet kant, som hjælper med at få afklaret sagen.

Lincolns henrettelse skal ske næste dag, så Veronica kontakter ham og får samtidig en vigtig allieret. Michael skal finde på en måde at få flyttet Lincoln ud fra sin isolationscelle, og de indsatte sætter alt på spil med deres livs flugt.

For at få Abruzzi tilbage på toppen i fængselshierakiet, og flugtplanen tilbage på sporet, må Michael afsløre for Philly Falzone, hvor Fibonacci befinder sig. Samtidig kommer Michael og Dr. Sara tættere på hinanden, mens flugtgruppen vokser sig større og større. Udenfor murene får Kellerman og Hale hjælp fra uønsket side til at finde LJ, og Veronica og Nick får et gennembrud.