T2, E1: En la segunda temporada de Kyle XY, surgen más preguntas y el peligro aumenta. Kyle empieza a saber la verdad sobre su pasado, pero bajo el estricto entrenamiento de Tom Foss, también debe conocer el alcance total de sus habilidades. Todo esto debe permanecer en secreto, incluso de los Trager, quienes solo quieren ayudarlo a volver a la vida de un adolescente normal. Kyle debe aprender a vivir con su doble vida y con los peligros desconocidos que acechan afuera de la casa de la familia. El peligro aumenta cuando liberan a la chica y empieza a buscar a Kyle.