Mobile Suit Gundam Seed

Han pasado 11 meses desde que la Alianza Terrestre y ZAFT (Zodiac Alliance of Freedom Treaty) entraron en guerra. En el L5, en el satélite Heliópolis de la colonia neutral Orb, el estudiante de ingeniería Kira Yamato se dirige al laboratorio como de costumbre. Allí se ve involucrado en un plan de extracción de Gundams de las fuerzas invasoras de ZAFT.

Athrun saca de entre las llamas el último Gundam, MS Aegis, y escapa. Kira y Murrue suben al Strike Gundam y por poco escapan de la explosión de la fábrica, ¡pero el MS GINN de ZAFT les está esperando! Murrue, que está herida y ni siquiera es piloto, no puede conducir el Gundam. Atrapado en una situación desesperada, Kira toma el control. Rápidamente, modifica el sistema operativo del Gundam....

Rau ataca a Kira con su MS CGUE. Justo entonces, el Arcángel aparece frente a ellos. El cañón del Strike Gundam que había disparado a Rau abre un gran agujero en la colonia. Su poder deja atónito a todo el mundo. Al ver que la suerte no está de su parte, Rau abandona la batalla. Kira aterriza en el Arcángel. La tripulación se sorprende al ver que un niño pilotaba el Gundam, pero Mu ve que Kira...

Desde el espacio aéreo de una Heliópolis destruida, Kira vuelve al Arcángel con una cápsula de salvamento. El Arcángel decide dirigirse al satélite militar aliado Ártemis para pedir ayuda. Cuando ya ha perdido de vista el Arcángel, Rau prevé cuál será su camino y elabora un plan para bloquear su ruta tanto por delante y como por detrás.

Los cuatro Gundam robados aparecen frente al Strike Gundam. Las fuerzas de ZAFT han decidido atacar con todos sus Gundam. Kira y Athrun vuelven a verse cara a cara. El Duel Gundam se interpone entre ellos, después se suman el Buster Gundam y el Blitz Gundam, y la lucha termina en un caos absoluto.

Huyendo de las fuerzas de ZAFT que lo persiguen, el Arcángel encuentra refugio en el satélite militar Ártemis. Sin embargo, la tripulación se ve amordazada por los supuestos soldados aliados. El comandante de Ártemis, Gerard García, retiene el Arcángel y a su tripulación.