Jane y el CBI entran en acción cuando un famoso quarterback jubilado (la estrella invitada CRAIG BIERKO) es dado por muerto después de la explosión de un coche.
Justin desaparece después de que el testamento de William cree tensión en la familia, y Nora, Kitty y Kevin lo buscan desesperadamente. Sarah tiene un comienzo difícil como jefa del negocio cuando se ve obligada a enfrentarse a la mala gestión de su padre.
Cuando una racha de asesinatos en la ciudad queda sin resolver, Monk entra en acción para encontrar una relación entre las víctimas y detener al asesino antes de que vuelva a actuar.
El equipo de la Unidad de Análisis de Conducta viaja a Yakima, Washington, cuando encuentran los restos de una docena de personas en el lecho de un río. Además, dan la bienvenida al nuevo miembro del equipo, Stephen Walker, un veterano criminalista del Programa de Análisis de Conducta del FBI.
Retomando el final de la última temporada, Mulder y Scully descubren que no son los únicos que buscan desesperadamente a su hijo perdido William. Puede que el destino del mundo dependa de ello.