Clark prueba los límites de su poder al salvar a su amigo telépata, Ryan, de un doctor malvado que quiere controlar sus poderes.
La agente Dana Scully tiene órdenes de desarticular un proyecto del FBI denominado "Expedientes X", que son casos relacionados con lo paranormal y que han sido reabiertos por el agente Fox Mulder.
El tío abuelo de Lana, condenado por asesinar a su esposa hace 40 años, le muestra a Lana la foto del hombre que cree que la mató.
Un delincuente al que Mulder ayudó a meter entre rejas sigue atormentándole a pesar de que se le da por muerto. Un médico de la cárcel que realiza experimentos ilegales revela que el enemigo de Mulder sigue vivito y coleando.
Mientras un místico nativo americano intenta curar a Mulder, Scully investiga archivos secretos sobre experimentos alienígenas y se convierte, sin saberlo, en el objetivo de un asesino.