K1, J2: Chain of Commandin toisessa jaksossa sota ääriliikkeitä vastaan jatkuu kaikkialla maailmassa. Irakissa, USA:n ja Irakin joukkojen palautettua itäisen Mosulin hallinta, taistelu siirtyy kaupungin länsipuolelle. Toisaalla merijalkaväen kersantti valmistautuu komennukselle Afganistaniin. Karibian alueella Trinidadissa muslimiyhteisö yrittää selvittää hälyttävän tilanteen, joka saa heidän nuorisonsa lähtemään maasta taistellakseen ISISin riveissä.