Mitä jos maailma, jossa elämme, onkin vain illuusiota? Mitä jos todellisuutemme onkin simulaatio? Kriitikoiden ylistämä ohjaaja Rodney Ascher etsii kysymykseen vastausta tieteestä, filosofiasta ja salaliittoteorioistakin. A Glitch in the Matrix pureutuu olemassaolomme syviin kysymyksiin sekä populäärikulttuuriviittausten että tieteellisten tutkimustulosten avulla. Suunvuoron saavat myös ihmiset, jotka ovat itse kokeneet "häiriön matriisissa".