Le Dr Scully est chargée de surveiller les activités d'un certain agent Mulder pour définir si son travail est digne d'intérêt pour le FBI. Il l'emmène en Oregon enquêter sur le meurtre de plusieurs lycéens qu'il pense être les victimes d'expériences pratiquées par des extra-terrestres...
Une femme qui prétend avoir vu un ovni dans son enfance voit sa fille disparaître au cours d'une excursion en camping. Tout semble indiquer l'implication d'extraterrestres…
Mulder apprend que son téléphone est sur écoute. Il découvre alors que l'appartement juste au-dessus du sien est occupé par un membre d'une branche secrète du FBI, qui enregistre toutes ses conversations depuis des années. Afin de mener son enquête pour enfin découvrir la vérité, Mulder demande à Scully de le faire passer pour mort.
Après avoir perdu connaissance, Scully est à l'hôpital, à l'article de la mort. L'homme à la cigarette propose à Mulder de la soigner à l'aide d'une puce électronique, ce dont le frère de Dana doute, en reprochant à l'agent la maladie de sa sœur.
Après la découverte d'un extraterrestre conservé par le froid d'un sommet du Canada, Mulder et Scully sont appelés afin d'étudier le corps. Alors que Scully prélevait un échantillon de glace, elle est attaquée par un chercheur du Pentagone qui semble en savoir beaucoup sur l'extraterrestre.