Jesse De Luna

Scofield manque de se faire prendre au jardin botanique où il allait récupérer de l'explosif qu'il avait caché. Il apprend que Mahone a récupéré son disque dur et s'en sert pour le retrouver. Scofield enquête sur Mahone, et va interroger sa femme, se faisant passer pour un agent d'une enquête interne du FBI. Sara comprend ou est le point de rendez-vous avec Scofield et part pour le Nouveau-Mexique. C-Note retrouve ses copains de son ancien gang, et organise avec eux de retrouver sa femme et sa fille malgré le FBI. Burrows et son fils continuent leur route pour retrouver Scofield, mais ils se font repérer dans une gare.

Un tremblement de terre réveille Nora en pleine nuit. Kevin est introuvable. L’espoir de sécurité qu’elle avait fondé sur leur installation dans une nouvelle ville s’évanouit. Les Murphy sont anéantis par la disparition d’Evie. Kevin reparaît, mais il n’a aucun souvenir de la nuit précédente et son téléphone, qui pourrait le rendre suspect dans la disparition des jeunes filles, manque à l’appel. Entretemps, une vieille ennemie refait surface d’une façon inattendue.

Walker et Alex se sont miraculeusement échappé de l’avion qui a coulé au fond d'un lac dans le dernier épisode de la saison précédente, mais ils courent toujours un grand danger.

Walker et Alex sont piégés à bord d’un avion qui s’est écrasé sur un lac isolé et qui est sur le point de couler.

Trente-six heures après le drame et les événements, les familles des victimes et les prévenus sont confrontés aux dures réalités de ce crime violent auquel tous sont liés.