Ryan, un jeune garçon télépathe retenu dans un centre de recherches, appelle Clark à son secours. Celui-ci l'aide à s'échapper et le ramène à Smallville. Nell, la tante de Lana, lui annonce son mariage et son déménagement à Métropolis. Mais Lana refuse de quitter Smallville...
Clark tente d'écraser Chloé en la pourchassant avec sa voiture. Après un choc, il reprend ses esprits mais ne se souvient pas de qui vient de se produire. La situation se corse lorsque Lana tente à son tour de tuer Chloé. Qu'est-ce qui les pousse à agir ainsi ? Qui peut bien en vouloir à ce point à la jeune femme ?
Le passé est un prologue. Des évènements-clés dans les histoires respectives de Lex et Clark vont les conduire - pour Lex volontairement et pour Clark involontairement - à rejoindre un programme d'expérimentation pour retrouver leurs souvenirs.
Un enfant se transforme subitement sous les yeux d'un policier. Une heure après, l'homme et deux de ses collègues sont assassinés et l'enfant a disparu. Olivia Dunham et toute son équipe partent enquêter à Edina, une petite ville où l'on entend un mystérieux bourdonnement et où tous les habitants cachent un lourd secret.
Il est maintenant temps de mettre Anna hors d'état de nuire. Erica et son équipe orchestrent alors le faux enlèvement de Lisa. Leur plan est d'attirer Anna loin de son équipe de sécurité pendant assez longtemps pour que la seule personne qu'elle n'aurait jamais pensé capable de trahison, sa propre fille, puisse l'éliminer. Lisa se dirige alors vers la Terre où Jack lui indique où elle doit se cacher. Lorsqu'Anna arrive dans la maison où Lisa est retenue prisonnière, elle joue à la mère inquiète pour tromper sa fille qui ne s'imagine pas que la situation s'inverse et que le piège est en train de se refermer sur elle...