Dans le premier épisode de la cinquième et dernière saison, la vie de Tom ne tient qu’à un fil alors qu’il dérive dans l’espace. Sur Terre, Anne aide à mener la 2e division en son absence.
Tom obtient une puissante nouvelle arme contre les Espheni. Ben met sa vie en jeu afin de dérober des plans à l’ennemi. Pope découvre que Tom est vivant et lance l’attaque finale. Pendant ce temps, la 2e division doit réévaluer sa situation lorsqu’un visiteur inattendu se présente.
Aidé des Volms, Tom prend la tête de milices humaines.
Dans la finale de la série, l’ultime combat voit les Mason, la 2e division et leurs alliés s’enfoncer dans les entrailles d’un lieu emblématique des États-Unis, maintenant truffé d’obstacles inédits et imprévisibles. Malgré d’importantes pertes en cours de route, ils doivent garder l’espoir de reprendre une fois pour toutes possession de la Terre au nom de l’humanité.
Les skitters ont attaqué la 2e Division, détruisant toutes les réserves de nourritures. Tom et Anne font alors une surprenante découverte.
