La desaparición de un importante funcionario da comienzo a una investigación que involucra a tres agentes policiales y a un criminal.
Cuando un conflicto en Europa del Este amenaza con empeorar, llaman al equipo Scorpion para que ayude a evitar la Tercera Guerra Mundial mediante reuniones pacificadoras secretas.
Ray, Ani y Paul toman las medidas necesarias para no ser detectados. Frank lidia con las consecuencias de su traición.
En el último episodio de la temporada, Ray y Ani intentan limpiar sus nombres y solucionar el asesinato de Casper.
Prentiss está lista para enfrentarse a su némesis, Ian Doyle, de una vez por todas. La UAC le pide a JJ que los ayude a encontrar a Prentiss y capturar a Doyle antes de que sea demasiado tarde.