在成為黑暗者後，艾瑪立即消失了，英雄們必須聯合起來拯救她，但首先他們必須找到她，這將需要一個出人意料的盟友的幫助。
悉尼發現了冰雪女王的行蹤，並同意給瑞金娜帶路，瑞金娜才不情願地與艾瑪聯手尋找冰雪女王。有貝兒幫忙照顧繈褓中的尼爾，緊張兮兮的瑪莉瑪格麗特和大衛準備開始產後的第一次約會，誰料威爾斯卡利特從鎮上的監獄逃出，約會夜變成了追捕夜。愛莎在童話鎮的樹林裏看到了安娜。同時在過去，年輕的艾瑪交到了一個很投緣的朋友，這個女孩和她一樣，也是離家出走的孤兒。
冰雪女王的魔咒消除之後，英雄們試圖收拾殘局，而瑞金娜不得不做出一個艱難的選擇。古德不擇手段追求權力，令虎克的命運岌岌可危，而他珍愛的每一個人都面臨危險。來到本劇季最終一章，在魔法森林的過去片段中，有人從侏儒怪的黑暗城堡掠走了貝兒，隨之而來的混亂將同時影響過去和未來。
艾瑪返回童話鎮，讓莉莉和瑪琳菲森團聚。而瑟琳娜的懷孕卻讓瑞金娜和羅賓難以招架。古德的健康每況愈下，以撒求助於新朋友，幫他獲取重寫歷史的魔法墨水。回到童話王國，在丹尼爾被殺的忌日，柯拉從仙境回來乞求瑞金娜的原諒，並發誓要幫助女兒找到真愛，但瑞金娜仍然懷疑母親別有用心。
對艾瑪可能走向黑暗一邊的擔憂籠罩著每個人，但當艾瑪意識到瑪琳菲森的女兒莉莉其實是她寄養家庭時期最親密的朋友後，便決心找到莉莉，讓她們母女團聚。瑞金娜和艾瑪齊心合力尋找莉莉，並警告羅賓提防瑟琳娜。同時在童話鎮，古德面臨一個跟貝兒有關的危機。在過去的寄養家庭時期，年輕的艾瑪和她的新家庭情況都在往好的方向發展，但莉莉的出現可能會打破一切。
