De camino a casa un día tras las clases, Konoha Koga rescata a Satoko Kusagakure, una ninja que ha huido de su aldea. Poco después, sus perseguidores aparecen para capturarla, pero Konoha los derrota con sorprendente facilidad. Y es que, en realidad, esta aparentemente inofensiva estudiante de secundaria es en realidad una asesina. Así comienza la peligrosa y peculiar convivencia entre una ninja fugitiva y una asesina profesional.