Una dozzina di anni fa, una pioggia di meteore caduta dal cielo aveva seminato distruzione sull'ignara cittadina di Smallville, Kansas, lasciando, negli anni successivi, varie cicatrici e segreti, agli abitanti.
Clark entra nella squadra di football della scuola e viene immediatamente promosso al ruolo di quarterback, quando il precedente quarterback litiga con Jason, il nuovo allenatore della squadra.
Clark e Lois (guest star ERICA DURANCE) indagano sull'apparente omicidio di Chloe, ma il padre di Lois, il generale Sam Lane (guest star MICHAEL IRONSIDE - "La tempesta perfetta") ostacola il loro progresso.
Kevin Grady (JONATHAN BENNETT) è in grado di far perdere la memoria alle persone e provoca a Clark un'amnesia totale. Chloe cerca di insegnare a Clark a usare i suoi superpoteri evitando nel frattempo di rivelarli agli altri. Clark incontra Lana, si innamora di lei e decide di rivelarle il suo segreto. Lex cerca di convincere Clark a mostrargli il nascondiglio delle tre pietre.
Clark incontra una nuova nemica quando Abigail Fine (BRIANNA LYNN BROWN), una timida ragazza del liceo, subisce un intervento di chirurgia plastica per migliorare il suo aspetto e aumentare la sua popolarità. Ma la sua bellezza alla Kryptonite provoca danni a chiunque lei baci e Abigail decide che la sua prossima vittima sarà Lana. Intanto, Jason e Lana nascondono la loro relazione a Clark.
