Nel primo episodio della terza stagione, Oliver cerca di mettere ordine nella sua vita.
Malcolm viene catturato da Ra's Ghul e portato a Nanda Parbat. Spinto dal suo legame con Thea, Oliver pensa di salvare Merlyn.
Nell'emozionante finale della terza stagione Ra's al Ghul mette in opera il suo piano supremo, mettendo in pericolo le vite di tutti.
Oliver è sorpreso dai cambiamenti all'interno del team Arrow. È abituato a gestire la situazione ma capisce che la squadra si è evoluta, portando a un aumento della tensione nel covo.
A causa di Malcolm, Oliver e Thea si ritrovano su Lian Yu con il vecchio nemico di Arrow, Deathstroke. Un flashback mostra Oliver e Maseo a Starling City per recuperare l'arma Omega.