Gli agenti tedeschi rivolgono domande ad Olivia quando ritorna il Sig. Jones, e viene rilasciata una tossina letale che causa la chiusura degli orifizi e la morte delle vittime senza volto.
Quando uno strano parassita si attacca agli organi interni di un agente, Dunham si precipita in Germania per incontrare un prigioniero che rivela dettagli su una minaccia molto più grande.
Nella prima puntata della terza stagione, dopo l'infarto, Bull torna al lavoro con un nuovo ricco cliente da rappresentare: una compagnia assicurativa citata in giudizio da una madre morente per aver negato la copertura del suo trapianto di fegato.
Diane scopre il piano di Alicia e Carey e lo comunica a Will, che va su tutte le furie e licenzia tutti quelli coinvolti nella 'cospirazione'. Alicia risponde a tono ed i due studi legali si affrontano in aula…
Joan indaga, per la prima volta da sola, sulla scomparsa di una donna che ha lasciato al marito un doloroso video in cui lo abbandonava e menzionava un omicidio su una banchina della metro.