Martin Klebba

Booth e Brennan si occupano dell'omicidio di un nano che in vita era una star del wrestling. Booth scopre che in seguito all'operazione al cervello, la sua mira da cecchino non è più quella di una volta e ha dei problemi ad superare i test dell'FBI. Inoltre una vecchia conoscenza fa ritorno in città.

Carla ed Elliot cercano di aiutare una paziente terminale a perdere la verginità, Danni si trasferisce da J.D e Cox tenta di convincere Turk a eseguire un trapianto di rene su un paziente che egli stesso ha fatto avanzare nella lista di attesa.

J.D. crede di aver finalmente trovato un mentore nel dottor Casey, un chirurgo affetto da disturbo ossessivo-compulsivo, che ha sempre attirato l'invidia di Cox. L'inserviente e il suo nuovo assistente aiutano Kelso con un problema di rifiuti.

J.D. lascia Kylie, che sembra indifferente, per Molly, appena tornata da Milwaukee. Carla si infuria per le frequenti telefonate che Turk fa a una sua ex ragazza. L'inserviente e Cox fanno una scommessa su Elliot.

J.D. ed Elliot tornano ad andare d'accordo, ma le abilità mediche di Elliot iniziano a mettere in secondo piano quelle di J.D. Elliot perde la calma quando capisce che l'inserviente aveva altro in mente quando le ha proposto di prendere un "caffè".

Una farfalla mostra i tanti modi in cui una giornata all'ospedale sarebbe potuta andare, mentre Turk cerca la sua bandana portafortuna per eseguire un intervento e Elliot tenta di trovare l'animale di pezza della sua paziente in attesa di trapianto.