S1, E1: 宇宙暦、6999年。神聖ラアルゴン帝国の開発した新兵器は、バリアを透過し艦内部で爆発する。軍事バランス崩壊が目前のため、宇宙に再び戦争時代をもたらそうとしていた。迫りくる危機「新たなる戦争」を前に、惑星連合宇宙軍は、あの「無責任男」を選択した…。かくして、『ひとりぼっちの戦争』が幕を開ける！