第1話

シーズン1 エピソード1: JAMSTEC (海洋研究開発機構) の新人･天谷深雪 (有村架純) は有人潜水調査船「しんかい6500」(6K) のパイロットを目指していた。亡き父･厚志 (時任三郎) もパイロットで、命を賭けて「深海の宇宙」と呼ばれる現象の解明に挑んでいたが、志半ばで病死。深雪も「深海の宇宙」に辿り着こうとしていた。そんな折、厚志のかつての友人･石堂 (遠藤憲一) が新理事長となり急激な組織改革を始め、深雪の夢をも否定する。