シーズン1、エピソード1: 話: 「The Answer」の出来事は、オリジナルゲームの終了直後、3月31日に始まる。オープニングでは、主人公がニュクスを倒したことに関連していると他のキャラクターが推測する「The Journey」の終わりに、真が死亡したことが明らかになる。学年が終わり、寮は閉鎖されようとしており、特別課外活動部（SEES）は離散しつつある。最後の夕食会中、SEESのメンバーは寮に閉じ込められ、3月31日が繰り返されていることに気づく。寮の床に大きなドアのような穴が開き、SEESはアイギスに似た対シャドウ兵器であるメティスに襲われる。