シーズン1、エピソード1: 時は戦国時代。戦乱によって親を亡くした獅子丸・沙織・小助の三人は、日本最高の忍者・果心居士によって飛騨の山にて育てられてきた。しかい、日本を戦乱と憎しみの坩堝に陥れようと企む大魔王ゴースンの使者オロチが果心居士を襲う...。