シーズン1、エピソード4: 「二度とCODEは使うな」と刑事･二宮湊人 (坂口健太郎) に忠告した佐々木慎介 (渋谷謙人) が、遺体で発見された。死因は覚醒剤の過剰摂取。二宮は佐々木の死を、悠香 (臼田あさ美) の事故への関与が疑われたまま亡くなった寺島貴司 (中島健) と同様に、何者かに殺されたと考えていた。そんな中、フリー記者･椎名一樹 (染谷将太) は、二宮を自らがCODEを調査するアジトへと連れて行く。ハッカーの三宅咲 (堀田真由) も交えた作戦会議が進む中、椎名たちは、佐々木が逃げる前に口にした「管理側」という言葉に引っかかる。佐々木を追っていた腕にミサンガをしていた女 (松下奈緒) が関係しているのではないかと調べを進めると、驚きの事実が明らかになり……?