ある日、キョウコは、置き手紙を残して小村の元から姿を消した。妻の突然の失踪に呆然とする小村は、図らずも中身の知れない小箱を同僚の妹に届けるために北海道へと向かうことになる。同じころ、小村の同僚の片桐が家に帰ると、そこには2メートルもの巨大な"かえるくん”が彼を待ち受けていた。かえるくんは迫りくる地震から東京を救うため、こともあろうに控えめで臆病な片桐に助けを求めるのだった-。