ロバート・ネビルは優れた科学者だが、人類を滅亡させた、その人間が作り出したウイルスは誰にも封じることができず、治すこともかなわかった。なぜか免疫があったネビルは、荒れ果てたニューヨークで、あるいは世界で、ただ1人生き残っていた。しかし、彼は“1人”ではなかった。ウイルスに侵され、変異した人間たちが闇に潜み彼を見つめていたのだ。ネビルを駆りたてているのは唯一残った使命――おそらく人類最後にして最大の希望の実現――を果たすことだった。それは、彼自身の免疫のある血液を使ってウイルスの影響を改善する方法を見つけること。しかし、彼には圧倒的多数の敵が迫り、時間は刻々となくなっていく……。