その日、巨大な球形の未確認飛行物体がニューヨークに襲来。アメリカ軍の攻撃はすべて跳ね返され、UFOはマンハッタンを破壊しながら進撃してゆく。エイリアンの正体を探っていたモロー博士は、恐るべき事実を掴む。飛来したのは偵察機にすぎず、本隊であるUFOの大群が外宇宙から接近していたのだ。そして遂に、敵はワシントンD.C.に到達。米軍が電磁波兵器による攻撃を繰り広げる中、ロンドン、パリ、東京、世界各地の大都市にもUFOが襲いかかるが……。