予報もなく突如発生する謎の竜巻群。その恐ろしい竜巻から、かろうじて難を逃れたジャドと一人娘のケリー。ケリーは、頻発する竜巻と、偶然受け取った奇妙な無線信号の不思議な関係に気づく。一方、竜巻の研究家であるゲイルはケリーの住む町に調査に訪れるのだが、怪しげなの黒服の男たちに調査を邪魔される。やがてケリーと父親のジャド、ゲイルはこの竜巻にはある国家的な秘密が隠されてるのではと思い始める…。