25歳でイングランド女王となったエリザベス1世。そして1587年。宮中では王座の転覆を狙う陰謀が渦巻き、外からは世界の列強が虎視眈々と侵攻の好機をうかがう。また、幽閉されていたスコットランドのメアリー王女によるエリザベス暗殺計画が動き出し、その背景ではさらなる陰謀が蠢いていた。勇敢で知的な航海士ローリーにつかの間の淡い気持ちを抱くエリザベスだったが、スペインとの友好関係がもろくも崩される事態が起こり、想像を絶する数の無敵艦隊がイングランドに押し寄せる！兵を奮い立たせ、英国艦隊総動員で迎え撃つエリザベス。凄絶な海戦の行方は、エリザベスの双肩にかかっていた―！