2049年、アメリカ。激増する犯罪を取り締まるため、政府はSEA[州取締局]という機関を設立。国民は、“スーツ”と呼ばれる装甲アーマーで武装した兵士とドローン機に監視され、反社会的な行動をとった者は直ちに逮捕されるか、処刑される。そんな暗黒の世界で、反逆の烙印を押されてしまったマーフィとジーンの兄妹。SEAの追跡部隊と激闘を繰り広げながら、逃亡を続ける2人。やがて、失われていたマーフィの記憶と、この世界に関する恐るべき秘密が明かされてゆく…。